ケニアへは飛行機を利用することができます。国内には3つの空港があり、世界各地へと国際線が数多く就航しています。まずはジョモ・ケニアッタ国際空港Jomo Kenyatta International Airport で、ケニアに入国する多くの観光客がこの空港を利用します。他にモイ国際空港 Moi International Airport、またエルドレット国際空港Eldoret International Airport は貨物便専用です。
ジョモ・ケニアッタ国際空港はエアー・インディア、ブリティッシュ航空、スイス航空、エジプト航空、サウディア航空など多くの航空会社が拠点としています。その他マラウィ航空、ジンバブエ航空、エミレーツ航空、サベナ航空、KLM、南アフリカ航空、ウガンダ航空、タンザニア航空などもこの空港を拠点としています。
ケニアの国営航空会社は、ケニア航空です。